气调冷库筹建气调库时，往往认为货源不成问题，待库建成后，在组织货源上却遇到麻烦，导致有些气调库因收不到足够的原料而效率低下。在质量方面，一是果农对贮藏果蔬质量的严格要求不了解，未能把好果蔬原料质量关，使得贮藏果蔬的原料质量很难控制，从而造成原料收购难，原料分级挑选处理难，影响了贮藏果蔬的质量;有些气调库限于人力、财力的不足，对入库果蔬未加严格挑选、检查，很难满足气调贮藏果蔬的质量要求。
二是进入气调库贮藏的农产品，要求采收后不得超过4～8小时，最多不能超过48小时(部分北方水果)就应及时入库贮藏，才能保证其新鲜度;然而我国果园的传统做法是将果品采摘后堆积在一起，等到树上的果实全部采摘完后，再陆续分选、包装、准备外销或入库，前后时间最短也得在10小时左右。
